Diante da necessidade de haver recursos humanos capacitados para atuar no ITEMA, a FAPEMA deu início, em 2005, ao primeiro Mestrado em Engenharia Aeroespacial do Maranhão, tendo como parceiros o ITA (Instituto de Tecnlogia da Aeronáutica) e a Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP).

Doze pessoas foram selecionadas para participar do programa, que foi divido em módilos teóricos e experimentais. Estes últimos são ministrados nos laboratórios do ITA, em São José dos Campos, São Paulo.